CMPA中致敏的成分主要是牛奶中的乳清蛋白 (α乳清蛋白、β乳球蛋白、牛血清白蛋白和牛免疫球蛋白)以及酪蛋白(α1、α2、β和K酪蛋白), 其中β乳球蛋白是牛奶中含量最丰富的乳清蛋白, 也是最主要的过敏原,而人乳中不含β乳球蛋白,且人乳中含有大量免疫调节因子和抗炎因子,能辅助消化蛋白,减少大分子物质吸收,所以人乳虽然也可致敏但发生率远远低于配方奶喂养新生儿。纯母乳喂养出现过敏症状的CMPA患儿,对深度水解奶粉仍可能不耐受,并且在过敏表现形式复杂的新生儿中高达40%,这类患儿表现出迟发型非IgE介导的过敏反应,如胃食管反流病、小肠结肠炎、直肠炎以及严重的特应性皮炎等。这种情况需要选择氨基酸配方奶粉。
具体操作可见下图。

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